10月16日～18日，由国家食品药品监管局牵头，国家发改委、卫生部等部委有关人员组成的国务院药品整治专项行动第一督查组一行9人，深入北京市大兴区亦庄以及宣武、昌平等区县的药品、医疗器械生产经营企业，基层医疗机构及药品监管部门，就北京市药品整治专项行动进展情况和完成质量进行了督导检查。督查组对北京市药品专项整治工作做出了积极评价，并要求北京市继续加大工作力度，把专项整治不断推向深入，切实做好2008年奥运会期间药品安全和保障工作。
督查组在听取工作汇报、查看资料的基础上，先后到北京同仁堂股份有限公司亦庄生产基地、北京京精医疗设备有限公司、北京双鹤药业、北京万东医疗、北京医药股份有限公司物流中心以及北京市药品监管局宣武分局、昌平分局等10多家单位进行了实地检查和座谈，并对昌平区农村药品“两网”建设情况进行了现场调研。督查组认为，北京市有条不紊、扎扎实实地开展了药品和医疗器械注册、生产、流通和使用环节的专项整治，预计可按期完成各项任务。北京市药品监管局作为专项整治牵头部门，与政府相关部门密切合作，形成合力，进一步净化了首都药品市场。同时，北京市将专项行动与奥运保障工作相结合，在药品生产环节开展了“闪电行动”，在药品流通环节开展了“飓风行动”，各项工作都有创新，药品监管水平不断提升，药品市场秩序进一步规范，专项整治取得了显著成效。
督查组希望北京市继续深入推进专项整治，确保各项措施落到实处。同时，要进一步创新监管思路和监管手段，建立药品监管长效机制，切实保障公众用药安全有效；进一步完善部门联动、协调配合的长效工作机制，巩固专项整治成果；按照北京市委、市政府统一部署，结合专项整治，采取有力措施，切实保障2008年奥运会期间药品市场安全和供应，务求万无一失。督查组要求北京市各相关部门，在奥运会前对全市兴奋剂生产经营情况进行全面排查，坚决取缔非法生产经营蛋白同化制剂和肽类激素，杜绝零售药店违法销售除胰岛素以外的该类产品，严防奥运会期间出现药源性兴奋剂管理问题。