“大医院不要欺压小医院，而是要有力提携小医院！”钟南山认为，在医改中，要明确这些综合性公立医院的作用和责任。
与先进国家不同，我国大医院与社区医院之间的医疗、技术和管理水平极为悬殊。钟南山认为，社区和基层医疗单位的水平与质量提高是解决看病难、看病贵问题的关键。“解决这个问题，除增加政府投资外，大医院应在技术、管理等方面与相关基层社区医院挂钩，将大医院提高基层社区医院水平的程度，作为评价大医院参与医改的重要考核指标。”
“我们一定要运用安全有效、价格低廉的手段，让广大百姓用得起药，看得起病。”他说，发展新型医药，为人民提供安全、有效、方便、价廉的医药卫生服务，这是医改的重要课题。“而开展这方面的研究，也应是大型医院需主要承担的责任。”