如果只是确立了基本药物目录，而不下大力气推广基本药物，通俗地说，就是医生在开药方的时候有意回避基本药物，仍然倾向于开贵药、多开药，导致患者不仅用药过多，而且使用了过多价格昂贵、但疗效不一定很高的药物该怎么办？这就需要在基本药物制度之外建立监督制约机制，加大处罚力度。
国务院深化医药卫生体制改革领导小组办公室8月18日召开会议，正式启动国家基本药物制度实施工作，发布《关于建立国家基本药物制度的实施意见》、《国家基本药物目录管理办法（暂行）》和《国家基本药物目录（基层部分）》。根据《关于建立国家基本药物制度的实施意见》，政府举办的基层医疗卫生机构全部配备和使用基本药物，其他各类医疗机构也都必须按规定使用基本药物。（《人民日报》8月19日）
与人们对医疗改革总体方案争议颇多相比，基本药物制度得到的待遇显然要高出许多，这不是因为人们对医疗改革总体方案太过苛刻，而是因为基本药物制度确实触及到了我国看病难、看病贵的某些痛处，让人们看到了药价回归甚至医疗体制成功改革的曙光。
基本药物制度是医疗体制改革的前提和关键，这个命题已经得到了世界众多国家的检验。目前，全世界约有160个国家和地区拥有正式的基本药物目录，而在这160个国家和地区中，多数都已经建立了免费医疗或全民医保的制度，正是因为基本药物制度以及建立在基本药物制度之上的配套机制，使得这些国家早早就规避或摆脱了诸如“以药养医”、“以药补医”导致国民看不起病的困扰。
但我们也应该看到的是，基本药物制度本身还面临着诸多困扰。首先，基本药物的确定是否科学。我国有13多亿人口，疾病的种类纷繁复杂，而基本药物却只有区区307种（现在市场流通的药物有两万多个品种），这显然是远远不够的。尤其值得一提的是，在美国和西欧的一些国家，他们并没有建立基本药物制度，这是因为在他们的医疗框架内，可以报销的药品种类太多了，根本没有搞基本药物制度的必要。
其次，基本药物制度的一些配套措施是否健全。比如，如果只是确立了基本药物目录，而不下大力气推广基本药物制度，通俗地说，就是医生在开药方的时候有意回避基本药物，仍然倾向于开贵药、多开药，导致患者不仅用药过多，而且使用了过多价格昂贵但疗效不一定很高的药物该怎么办？这就需要在基本药物制度之外建立监督制约机制，加大处罚力度。另外，也还要防止在药物名称上做文章，防止“偷梁换柱”、“换汤不换药”的情况发生，避免基本药物成摆设。所以说，指望基本药物制度改变“以药补医”还不太靠谱。
最后，基本药物制度还只是医疗体制改革的第一步，众所周知，我国医疗领域的核心问题是医疗资源分布不均衡（看病难），进不起医院的门（看病贵），而看病贵的关键并不只是药品贵，还包括检查贵和医疗腐败现象。更重要的是，由于长期以来所形成的“以药养医”的利益格局已经形成，医院里还有大量势力指望卖高价药过日子，在医疗投入不足以弥补这些窟窿的前提下，推行基本药物制度的难度可想而知。所以说，基本药物制度虽好，但暂时别寄予过多期望，这样注定会失望，问题的关键是，如何让这个可喜的第一步迈稳、迈扎实、迈得有意义。