全国中小学校舍安全工程领导小组办公室（简称全国校安办）和各省级中小学校舍安全工程办公室分别设立了监督举报电话，负责受理、调查并核实群众反映的问题，广泛听取社会各界的意见和建议。其中全国校安办监督电话为010-66092019，北京市的为010—66074232和 51994783。
教育部副部长、全国校安办主任鲁昕表示，组织实施好校舍安全工程是一项限时保量必须完成的政治任务，是一项人命关天的工程，是一项“等不起”的工程。
全国校安办表示，监督举报的重点是：是否完成工程目标和任务，是否严格执行技术标准和规范，是否落实工程资金并规范管理，是否建立信息公示制度等。
全国校安办承诺，一旦发现诸如没有对现有校舍进行逐栋排查和鉴定、出具鉴定报告的机构不具备专业资质，没有按照重点设防类标准和综合防灾要求加固改造和建设校舍，工程实施中存在严重的质量问题，发生挤占、挪用、截留、套取工程资金等重大问题，可通过拨打当地监督举报电话向校安办直接反映，当地校安办将根据举报线索予以调查核实并依据有关规定进行处理。
对重大问题，在向当地校安办反映的同时，还可向全国校安办举报，全国校安办将进行重点核查和处理。