触摸屏不灵敏
在小米官网上，关于小米3的描述中写着“超灵敏触控视网膜屏”，然而实际情况是很多用户在使用时能明显感觉到灵敏度存在问题，一个应用有时需要点击好几次，有时甚至点了几次都没反应，在输入文字信息时还经常出现漏输、掉字的情况。这个问题在小米用户中普遍存在，并且持续了相当长的一段时间。
10月25日小米MIUI系统发布更新，表示问题解决。小米工作人员也在bug反馈专区回复说更新到3.10.25开发版的系统可以解决此问题。系统更新之后的用户也反应灵敏度问题得到较大改善，从此之后在论坛里抱怨触屏灵敏度问题的帖子才逐渐变少，但是并没有彻底消失。
“Keyant”的帖中这样描述：我身边的一个同学就是靠省吃俭用才买到期盼已久的小米作为他人生拥有的第一台智能机，悲剧的是这是一台有毛病的小米，比如打字不灵敏，尽管升级到3.10.25的开发版后好了很多，但这位同学已然落下了老年人打字的毛病(每次都重重的按在屏幕上)，我看着心里实在不是滋味。
从用户体验上来说，这个问题实在不小，与小米宣称的超灵敏触控更是相去甚远。虽然官方声音表示问题已经解决，可是给用户留下的心里阴影却一时难以去除。
不清晰的相机
小米3弱光条件下拍出的照片（充满噪点）
小米3发布时，相机是官方宣传的重点，给人的感觉是有了小米3，其他单反相机都要被秒杀的，这让无数爱好拍照的米粉们心痒难搔。小米的网站上对相机的描述也是不遗余力：1300万像素堆栈式索尼相机，F2.2的光圈和28mm的广角，5片特制镜头……一堆道不完的参数都在努力证明小米3拍照功能是多么强大，拍出的效果是多么惊人。然而很多米粉拍照后发现，根本就不是宣传的那么一回事。
更令人不解的是，相机成像的问题各不相同，有的米粉表示相机拍照出来的图片发黄发绿，颜色严重失真，拍出的照片连500万像素手机都不如，这个1300万像素号称媲美单反看来更像是个噱头;有的表示对焦成问题，明显很模糊的状态却提示对焦成功;有的表示光线充足情况下不算差，可是在弱光环境下噪点相当严重，可以看到明显的雪花;有的表示照片质量不佳，特别是细节上丢失严重……总之，小米相机成像问题不少，离官方宣传的效果相去太远。
相机成像问题是在小米3bug反馈专区里反应最强烈的问题之一，但是到目前为止，官方也没有给出一个明确的答复。按照小米的习惯，每周官方会按时放出一个更新的系统，但是米粉们发现每次更新之后拍照效果依然不好。
一些米粉开始担心，如果只是软件上的问题，更新系统迟早总是能解决的，只在于时间长短;如果是硬件上的死伤，或许只能跟着官方发布的系统盲目更新，毕竟期盼小米承认相机存在重大问题轻易给用户换手机是一件不大可能的事，更不用说因为无法解决相机问题而大面积召回了。
电流声很大
小米手机3网上限量发售之后，有一些米粉有幸先得到小米3。然而没过几日就有用户反映手机打电话电流声很大，随后又有细心的用户发现，当用户把小米耳机插入小米3，不播放任何音乐的情况下，会听到电流声，并且声音挺大，不做任何操作过一会会消失;还有用户发现在很安静的情况下，开启静音模式，开启带声音的程序(如游戏音乐等)，扬声器中依旧能听到沙沙的电流声，关掉程序声音才会消失;类似的还有播放音乐时按暂停键，可以清晰地听到电流声……这样的帖子在bug反馈专区一经发出，立刻引起其他用户的注意，并按照提供的方法进行测试，果然发现存在电流声的问题。
一位家住杭州的米粉，在论坛上看到关于电流声的帖子之后，测试发现自己的小米3也存在这样的问题，于是带着手机去了杭州的小米之家，请求帮忙检测。令人意外地是，小米之家的检测员竟然没听说过这样的问题，更不用说如何听电流声了。在这位米粉的帮助下，检测员也听到了电流声，然后他又拿小米之家工程师的小米3听了一下，发现也存在这样的问题。
随后这位检测员给这位米粉提出了建议：如果影响使用的话可以换机，不过不建议换，因为看来问题是普遍的，所以换来的机器可能还会有这个问题。
“Keyant”继续在帖中写到： “再比如听音乐有电流声延续的问题，我实在不想破坏他手拿小米的喜悦心情，已不忍心提醒他正常的手机不应该是这样子的(还好他用的是49元的平塞耳机，不是非常仔细还真听不到电流声，估计是这款耳机阻抗较高的缘故，但如果用好一点的入耳式就能听到令人难以忍受的电流声了，几十块的MP3都不会这样的啊)，要是别人对小米提出点异议，他都会极力为小米辩护。”
真心为小米有这样的用户而感到骄傲!
截止记者发稿，不论是小米官方还是小米论坛都没有对电流声问题做出任何有效回复。
而有米粉反映更新到11月8日的系统电流声的问题得到了改善，但是问题也还存在，也有米粉表示更新系统之后，依然听得到电流声。
看起来电流声的问题小米还没有彻底解决好。
